Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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