Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9CRC3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms