Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms