Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms