Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc8Q8VD72 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ttc8Q8VD72 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc8Q8VD72 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms