Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms