Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nup35Q8R4R6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms