Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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