Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms