Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms