Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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