Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca8Q8BHX3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms