Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALYREFQ86V81 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALYREFQ86V81 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms