Protein–RNA interactions for Protein: Q810U4

Nrcam, Neuronal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrcamQ810U4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrcamQ810U4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrcamQ810U4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrcamQ810U4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms