Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms