Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nell2Q61220 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms