Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms