Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms