Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm12888Q3UW77 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm12888Q3UW77 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm12888Q3UW77 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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