Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms