Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms