Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Cpne9Q1RLL3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Cpne9Q1RLL3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Cpne9Q1RLL3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cpne9Q1RLL3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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