Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnma1Q08460 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms