Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms