Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms