Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms