Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms