Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx2P81066 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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