Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms