Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Setd4P58467 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms