Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcanP55066 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NcanP55066 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcanP55066 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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