Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NrlP54846 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NrlP54846 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NrlP54846 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms