Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms