Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms