Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NdnP25233 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NdnP25233 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NdnP25233 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NdnP25233 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NdnP25233 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NdnP25233 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NdnP25233 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NdnP25233 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NdnP25233 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms