Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms