Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtaP09225 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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LtaP09225 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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