Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffaO54786 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffaO54786 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffaO54786 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffaO54786 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffaO54786 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffaO54786 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffaO54786 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffaO54786 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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