Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Timm44O35857 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Timm44O35857 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms