Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10477F6SW83 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10477F6SW83 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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