Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snai3Q9QY31 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms