Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms