Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Syde1Q9DBZ9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Syde1Q9DBZ9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Syde1Q9DBZ9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syde1Q9DBZ9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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