Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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