Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkrip1Q9CWV6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms