Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms