Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata4Q8K3V1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms