Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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SbsnQ8CIT9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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SbsnQ8CIT9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms