Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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