Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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